¿Qué es rna seq?

El RNA-Seq (Secuenciación de ARN) es una técnica utilizada para analizar el transcriptoma, es decir, el conjunto de ARN presentes en una célula en un momento dado. Permite identificar y cuantificar los transcritos generados a partir del genoma de un organismo en particular.

La secuenciación de ARN se basa en la conversión del ARN en una biblioteca de ADN complementario (cDNA), el cual puede ser secuenciado utilizando técnicas de secuenciación de nueva generación (NGS, por sus siglas en inglés). La secuenciación masiva de estos fragmentos de cDNA permite obtener millones de lecturas cortas, que luego pueden ser mapeadas al genoma de referencia o a un conjunto de transcritos conocidos.

El RNA-Seq tiene varias aplicaciones, entre las que se incluyen:

1. Análisis de expresión génica: Permite identificar y cuantificar los niveles de expresión de los diferentes genes en una muestra biológica. Esto puede utilizarse para estudiar cambios en la expresión génica en diferentes condiciones, como por ejemplo, en enfermedades o durante el desarrollo.

2. Identificación de variaciones en el ARN: Permite identificar y cuantificar variantes de ARN, como isoformas alternativas o eventos de empalme alternativo.

3. Descubrimiento de nuevos transcritos: Permite identificar nuevos transcritos que aún no han sido caracterizados o que no están presentes en las bases de datos existentes.

4. Análisis de la estructura del ARN: Permite estudiar eventos de empalme alternativo, así como características estructurales del ARN como la formación de horquillas de ARN o el plegamiento en estructuras secundarias.

El RNA-Seq ha revolucionado el campo de la genómica funcional, permitiendo obtener una visión más completa del transcriptoma y facilitando la identificación de nuevos genes y variantes de ARN. Además, la secuenciación masiva de ARN ha disminuido significativamente los costos y los tiempos de análisis en comparación con las técnicas tradicionales, como los microarreglos de ARN.